ومن أبرز المهام التي يتولى المجلس القومى للصحة النفسية، مايلى:
1.وضع السياسات التي تضمن احترام حقوق وسلامة المرضي النفسيين.
2. مراقبة أحوال دخول وحجز وعلاج المرضي النفسيين والتأكد من تمتعهم بالضمانات والحقوق المنصوص عليها في هذا القانون.
3. البت في التظلمات من قرارات المجالس الإقليمية للصحة النفسية.
4. وضع معايير الترخيص الصادر من وزارة الصحة والسكان بإدارة وتشغيل المنشآت النفسية.
5. تشكيل لجنة فنية من الأطباء المتخصصين للاطلاع علي سجلات المرضي عند اللزوم.