صدر له أكثر من 20 كتاباً ومقالات عديدة في التاريخ والفكر السياسي والاجتماعي والأدب، وكانت كتاباته عن مصر وأحداث مصرية تاريخية أثرت فى حياة المصريين، ومنها:
الثورة العرابية
أصدر صلاح عيسى أول كتبه بعنوان “الثورة العرابية” عام 1979 عن الهيئة المصرية العامة للكتاب. ويناقش ويرصد صلاح عيسى في دراسته للثورة العرابية (من خلال عدة فصول) “الاحتكارات الاوربية من الاحتلال السلمى إلى الغزو المسلح والخريطة الاجتماعية والفكرية للثورة ومسألة السلطة وأخيرا الجبهة الثورية من الوحدة إلى التفتت”، وقد جاء الكتاب في 612 صفحة، واعتمد عيسى في كتابته على مذكرات قادة الثورة العرابية وعدد من الوثائق التاريخية المصرية والإنجليزية والفرنسية.
رجال مرج دابق
اعتبر صلاح عيسى فى هذا الكتاب أن رجال مرج دابق هم الخونة من رجال مماليك السلطان “قنصوة الغوري” الذين باعوه للسلطان العثماني “سليم الأول”، فكانت هزيمة المصريين والشوام، ثم رجال السلطان المملوكي الأخير “طومان باي”، الذي شنقه “سليم الأول”، تحت “باب زويلة” في القاهرة، ثم انتهى الأمر باحتلال عثماني مظلم دامٍ للمنطقة العربية حوالى أربعة قرون.
رجال ريا وسكينة
استطاع صلاح عيسى أن يسرد وقائع قضية “ريا وسكينة” بشكل صحفى دقيق من خلال التطلع والبحث في الدفاتر القديمة، وتناول الحدث بواقعية ودون إضافة الطابع الكوميدي أو التراجيدي أو الدرامي كما تم في أعمال أخرى غطت القضية.
مصرع مأمور البدارى
يستعرض صلاح عيسى فى هذا الكتاب، الجانب الخفي المتعلق بالطاغية إسماعيل صدقي باشا، الذي دفعته نشأته الأرستقراطية وفشله السياسي لاحتقار المصريين، والذين بدورهم أعطوا لحكامهم دروساً قاسية على مدى التاريخ.
يقترب الكاتب من الوعي الشعبي الجمعي، وقدرته على مقاومة المحتل، مشيراً إلى المنتج الاجتماعي في هذه الفترة، ممثلاً بأحمد جعيدي الشاب ابن الطبقة الاجتماعية الفقيرة “العاطل” الذي يثأر لكرامته ويقتل مأمور قسم البداري محمود الشافعي الذي ينتمي لنظام إسماعيل صدقي ويستخدم وسائل العقاب نفسها، ويحكم على جعيدي بالإعدام إلا أن محكمة النقض توصي بتخفيف الحكم الأمر الذي يغضب صدقي،