ذكر قانون إدارة المخلفات الصادر برقم 202 لسنة 2020، إن موارد جهاز المخلفات تأتى بعدة طرق منها المبالغ المخصصة لها في الموازنة العامة إلى جانب المنح والهبات والتبرعات والإعانات التي يقبلها مجلس الإدارة.
ونصت المادة رقم 12 من القانون على أنه تتكون موارد الجهاز مما يأتي :
١ – المبالغ التي تخصص له في الموازنة العامة للدولة .
٢ – المنح والهبات والتبرعات والإعانات التي يقبلها مجلس الإدارة بما لا يتعارض مـع أغراضـه .
٣ – حصيلة رسوم إصدار التراخيص والتصاريح والموافقات التي يصدرها الجهاز ، ومقابل الموافقة علي التنازل عن التراخيص للغير بما لا يجاوز مائتي ألف جنيه عن كل ترخيص أو تصريح أو موافقة ، ويصدر بتحديد فئاتها قرار من الوزير المختص بعد موافقة مجلس الإدارة .
ويحصل هذا الرسم بنظام الدفع الإلكتروني أو نقدا بموجب إيصال سداد .
٤ – مقابل الأعمال أو الاستشارات الفنية والتوصيات أو الخدمات التي يؤديها الجهاز للغير .
٥ – عوائد استثمار أموال الجهاز .
٦ – الغرامات التي يحكم بها في الجرائم ومقابل التصالح المنصوص عليها في هذا القانون ، فيما عدا ما ورد بالبند رقم (6) من المـادة (35) من هذا القانون .
٧ – حصيلة المقابل المنصوص عليه بالمـادة (17) من هذا القانون .
٨ – أي موارد أخري يوافق عليها مجلس إدارة الجهاز بما لا يتعارض مع أغراضه .